• facebook
  • linkedin
  • youtube

Despois de que o estudoso estadounidense Eric S. Lander propuxese formalmente o polimorfismo de nucleótido único (SNP) como marcador molecular de terceira xeración en 1996, o SNP utilizouse amplamente na análise de asociacións de trazos económicos, na construción de mapas de enlaces xenéticos biolóxicos e na selección de xenes patóxenos humanos., Diagnóstico e predición de risco de enfermidades, detección individualizada de medicamentos e outros campos de investigación biolóxica e médica.No campo do cultivo de cultivos comerciais, a detección de SNP pode realizar unha selección precoz dos trazos necesarios.Esta selección ten as características de alta precisión e pode evitar eficazmente a interferencia da morfoloxía e os factores ambientais, acurtando así moito o proceso de reprodución.Polo tanto, o SNP xoga un papel importante no campo da investigación básica.

O polimorfismo de nucleótido único (Single Nucleotide Polymorphism, SNP) refírese ao fenómeno de que hai diferenzas de nucleótido único na mesma posición na secuencia de ADN de individuos da mesma ou de diferentes especies.A inserción, eliminación, conversión e inversión dunha única base poden causar esta diferenza.No pasado, a definición de SNP era diferente da de mutación.Un locus variante require que a frecuencia dun dos alelos da poboación sexa superior ao 1% para ser definido como locus SNP.Porén, coa expansión das teorías biolóxicas modernas e a aplicación da tecnoloxía, a frecuencia dos alelos xa non é unha condición necesaria para limitar a definición de SNP.Segundo os datos de variación de nucleótidos únicos incluídos na base de datos de polimorfismos de nucleótidos únicos (dbSNP) baixo o National Center for Biotechnology Information (NCBI), tamén se inclúen a inserción/deleción de baixa frecuencia, a variación de microsatélites, etc.

Etiquetaxe e detección molecular de SNP1

No corpo humano, a frecuencia de SNP é do 0,1%.Noutras palabras, hai unha media dun sitio SNP por 1000 pares de bases.Aínda que a frecuencia de aparición é relativamente alta, non todos os sitios SNP poden ser marcadores candidatos relacionados con trazos.Isto está relacionado principalmente coa localización onde se produce o SNP.

Teoricamente, o SNP pode aparecer en calquera lugar da secuencia do xenoma.Os SNP que se producen na rexión codificante poden producir mutacións sinónimos e mutacións non sinónimas, é dicir, o aminoácido cambia ou non cambia antes e despois da mutación.O aminoácido modificado adoita facer que a cadea peptídica perda a súa función orixinal (mutación con sentido erróneo) e tamén pode provocar o aborto da tradución (mutación sen sentido).Os SNP que se producen en rexións non codificantes e rexións interxénicas poden afectar ao empalme do ARNm, á composición da secuencia de ARN non codificante e á eficiencia de unión dos factores de transcrición e do ADN.A relación específica móstrase na figura:

Tipos de SNP:

Etiquetaxe e detección molecular de SNP2

Varios métodos de tipificación SNP comúns e a súa comparación

Segundo diferentes principios, os métodos comúns de detección de SNP divídense nas seguintes categorías:

Comparación de clasificación de métodos de detección

Etiquetaxe e detección molecular de SNP3

Nota: na táboa utilízanse actualmente métodos de detección de SNP máis comúns, outros métodos de detección como a hibridación de sitios específicos (ASH), extensión de cebador de sitio específico (ASPE), extensión de base única (SBCE), corte de sitio específico (ASC), tecnoloxía de chip xenético, tecnoloxía de espectrometría de masas, etc., non foron clasificados nin comparados.

O custo e o tempo da purificación de ácidos nucleicos nos anteriores métodos de detección de SNP comúns son inevitables.Non obstante, os kits relacionados baseados na tecnoloxía de PCR directa de Foregene poden realizar directamente a amplificación de PCR ou qPCR en mostras non purificadas, o que proporciona unha comodidade sen precedentes para a detección de SNP.

Os produtos da serie PCR directa de Foregene omiten de forma simple e groseira os pasos de purificación da mostra, o que reduce moito o tempo e o custo necesarios para preparar modelos.A única polimerase Taq ten unha excelente capacidade de amplificación e pode tolerar unha variedade de inhibidores de ambientes de amplificación complexos.Estas características proporcionan unha garantía técnica para a obtención de produtos específicos de alto rendemento.Kits Foregene Direct PCR/qPCR para diversos tipos de mostras, tales como: tecidos animais (cola de rata, peixe cebra, etc.), follas de plantas, sementes (incluíndo mostras de polisacáridos e polifenois), etc.


Hora de publicación: 23-Xul-2021