• facebook
  • linkedin
  • youtube

Aparición do SARS-CoV-2 B.1.1.7 Linaxe

Estados Unidos, 29 de decembro de 202012 de xaneiro de 2021

Summer E. Galloway, doutoramento 1;Prabasaj Paul, doutoramento 1;Duncan R. MacCannell, doutor 2;Michael A. Johansson, doutor 1;

John T. Brooks, MD 1;Adam MacNeil, doutor 1;Rachel B. Slayton, doutora 1;Suxiang Tong, doutoramento 1;Benjamin J. Silk, doutor 1;Gregory L. Armstrong, MD 2;

Matthew Biggerstaff, ScD 1;Vivien G. Dugan, doutora

O 15 de xaneiro de 2021, este informe publicouse como MMWRPublicación anticipada no sitio web de MMWR (https://www.cdc.gov/mmwr).

O 14 de decembro de 2020, o Reino Unido informouunha variante de preocupación SARS-CoV-2 (VOC), liñaxe B.1.1.7,tamén denominado VOC 202012/01 ou 20I/501Y.V1.* OEstímase que a variante B.1.1.7 xurdiu en setembro2020 e converteuse rapidamente no circulante dominanteVariante SARS-CoV-2 en Inglaterra (1).B.1.1.7 foidetectado en máis de 30 países, incluídos Estados Unidos.Comodo 13 de xaneiro de 2021, aproximadamente 76 casos de B.1.1.7 teñendetectado en 12 estados de EE.Múltiples liñas de evidenciaindicar que B.1.1.7 transmítese de forma máis eficiente que o sonoutras variantes do SARS-CoV-2 (13).A traxectoria modelada deesta variante en EE. UU. presenta un rápido crecemento a principios de 2021,converténdose na variante predominante en marzo.AumentouA transmisión do SARS-CoV-2 pode ameazar a atención sanitaria tensarecursos, requiren unha implementación máis extensa e rigorosade estratexias de saúde pública (4), e aumentar a porcentaxe deinmunidade da poboación necesaria para o control da pandemia.TomandoAs medidas para reducir a transmisión agora poden diminuír o potencialimpacto de B.1.1.7 e permitir un tempo crítico para aumentar a vacinacobertura de ción.En conxunto, vixilancia xenómica melloradacombinado co cumprimento continuo do público efectivomedidas sanitarias, incluíndo vacinación, distanciamento físico,uso de máscaras, hixiene de mans e illamento e corentenaser esencial para limitar a propagación do SARS-CoV-2, o virusque causa a enfermidade por coronavirus 2019 (COVID-19).Estratéxicoprobas de persoas sen síntomas pero con maior riscoinfección, como aqueles expostos ao SARS-CoV-2 ou que teñencontacto frecuente e inevitable co público, proporciona outrooportunidade de limitar a propagación en curso.

Vixilancia xenómica global e intercambio rápido de código abertoA creación de secuencias do xenoma viral facilitou case tempo realdetección, comparación e seguimento do SARS-CoV-2 en evoluciónvariantes que poden informar os esforzos da saúde pública para controlar opandemia.Mentres que algunhas mutacións no xenoma viralxurdir e despois retroceder, outros poden conferir un avance selectivotage á variante, incluíndo a transmisibilidade mellorada, de xeito quetal variante pode dominar rapidamente outras variantes circulantes.

A principios da pandemia, variantes de SARS-CoV-2 que conteñena mutación D614G na proteína espiga (S) que aumentaa avidez de unión ao receptor tornouse rapidamente dominante en moitosrexións xeográficas (5,6).A finais do outono de 2020, varios países informaron de detectarVariantes do SARS-CoV-2 que se propagan de forma máis eficiente.Ademáisá variante B.1.1.7, destacan as variantes B.1.351liñaxe detectada por primeira vez en Sudáfrica e a recentemente identificadaB.1.1.28 subclade (rebautizado como"P.1) detectado en catro viaxeirosde Brasil durante a proxección de rutina no Haneda (Tokio)aeroporto.§ Estas variantes levan unha constelación de muta xenéticacións, incluíndo no dominio de unión ao receptor da proteína S,que é esencial para unirse á célula hóspede angiotensina-receptor da enzima convertidora-2 (ACE-2) para facilitar o virusentrada.A evidencia suxire que outras mutacións se atoparon nestesvariantes poden conferir non só unha maior transmisibilidade senóntamén pode afectar o rendemento dalgúns diagnósticos en tempo realtranscrición inversareacción en cadea da polimerase (RT-PCR)ensaiose reducir a susceptibilidade aos anticorpos neutralizantes(2,3,510).Un informe de caso recente documentou o primeiro caso deReinfección do SARS-CoV-2 no Brasil cunha variante do SARS-CoV-2que contiña a mutación E484K,** que se mostroupara reducir a neutralización por soros convalecentes e monoclonaisanticorpos (9,10).

Este informe céntrase na aparición da variante B.1.1.7nos Estados Unidos.A partir do 12 de xaneiro de 2021, nin oB.1.351 nin as variantes P.1 foron detectadas noEstados Unidos.Para obter información sobre o SARS-CoV-2 emerxentevariantes de preocupación, CDC mantén unha páxina web dedicada aproporcionando información sobre as variantes emerxentes do SARS-CoV-2.††

 B.1.1.7 liñaxe (20I/501Y.V1)

A variante B.1.1.7 leva unha mutación na proteína S(N501Y) que afecta a conformación da unión ao receptordominio.Esta variante ten outras 13 mutacións que definen a liñaxe B.1.1.7 (táboa), varias das cales están na proteína S,incluíndo unha supresión nas posicións 69 e 70 (del6970) queevolucionou espontáneamente noutras variantes do SARS-CoV-2 e éhipótese para aumentar a transmisibilidade (2,7).A eliminaciónnas posicións 69 e 70 provoca falla do xene S (SGTF)en polo menos unha RT-PCRensaio diagnóstico baseado (é dicir, coEnsaio ThermoFisher Taq Path COVID-19, o B.1.1.7 variformiga e outras variantes co del6970 producen un negativoresultado para o xene S diana e un resultado positivo para os outros dousobxectivos);SGTF actuou como apoderado no Reino Unidopara identificar B.1.1.7 casos (1).Varias liñas de evidencia indican que B.1.1.7 é máistransmisión eficiente en comparación con outros SARS-CoV-2variantes que circulan no Reino Unido.rexións do Reino Unido conunha maior proporción de secuencias B.1.1.7 tivo unha epidemia máis rápidacrecemento que outras áreas, os diagnósticos con SGTF aumentaronmáis rápido que os diagnósticos non SGTF nas mesmas áreas, e amaior proporción de contactos foron infectados por pacientes índicecon B.1.1.7 infeccións que por pacientes índice infectados conoutras variantes (1,3).A variante B.1.1.7 ten o potencial de aumentar a panorámica dos EUAtraxectoria démica nos próximos meses.Para ilustrar este efecto,desenvolveuse un modelo de compartimentos sinxelo e de dúas variantes.A prevalencia actual dos EUA de B.1.1.7 entre todos os que circulanvirus é descoñecido pero pénsase que é <0,5% en función donúmero limitado de casos detectados e datos do SGTF (8).Parao modelo, os supostos iniciais incluían unha prevalencia B.1.1.7do 0,5% entre todas as infeccións, a inmunidade ao SARS-CoV-2infección previa do 10%30%, unha reprodución variable no temponúmero (R t ) de 1,1 (transmisión mitigada pero crecente)ou 0,9 (diminución da transmisión) para as variantes actuais, e unha incidencia reportada de 60 casos por 100.000 persoas por día en1 de xaneiro de 2021. Estes supostos non representan precisamentecalquera localización dos EUA, senón que indica unha xeneralización decondicións comúns en todo o país.O cambio en R t sobretempo resultante da inmunidade adquirida e aumento da prevamodelo de B.1.1.7, asumindo a R t de B.1.1.7ser unha constante 1,5 veces a R t das variantes actuais, baseándose enestimacións iniciais do Reino Unido (1,3).A continuación, modelouse o impacto potencial da vacinaciónsupoñendo que se administrasen 1 millón de doses de vacina pordía que comeza o 1 de xaneiro de 2021 e esa inmunidade do 95%.conseguiuse 14 días despois da recepción de 2 doses.En concreto,inmunidade contra a infección con variantes actuais ou asAsumiuse a variante B.1.1.7, aínda que a eficacia ea duración da protección contra a infección segue sendo incerta,porque estes non eran o criterio final principal dos ensaios clínicospara as vacinas iniciais.Neste modelo, a prevalencia de B.1.1.7 é inicialmente baixa, aínda que porqueé máis transmisible que as variantes actuais, exhiberápido crecemento a principios de 2021, converténdose na variante predominanteformiga en marzo (Figura 1).Se a transmisión de correntevariantes está aumentando (R t inicial = 1,1) ou diminuíndo lentamente(R t inicial = 0,9) en xaneiro, B.1.1.7 provoca un cambio substancialna traxectoria de transmisión e unha nova fase de exponencialcrecemento.Coa vacinación que protexe contra a infección, oas primeiras traxectorias epidémicas non cambian e B.1.1.7 esténdeseaínda ocorre (Figura 2).Non obstante, despois de que B.1.1.7 convértese envariante dominante, a súa transmisión reduciuse substancialmente.O efecto da vacinación na redución da transmisión próximao prazo foi maior no escenario no que se atopaba a transmisiónxa decrecente (R t inicial = 0,9) (Figura 2).Os primeiros esforzos quepode limitar a propagación da variante B.1.1.7, como universal eun maior cumprimento das estratexias de mitigación da saúde pública,permitirá máis tempo para que a vacinación en curso acade maiorinmunidade a nivel poboacional.

Discusión

Actualmente, non hai diferenzas coñecidas nos resultados clínicosasociado coas variantes descritas do SARS-CoV-2;con todo,unha maior taxa de transmisión levará a máis casos, aumentandoo número total de persoas que necesitan atención clínica, exacerbareducindo a carga dun sistema de saúde xa tenso,e provocando máis mortes.Vixilancia xenómica continuadaidentificar B.1.1.7 casos, así como a aparición doutrosvariantes de preocupación nos Estados Unidos, é importante para oResposta da saúde pública ao COVID-19.Mentres que o SGTF resultapode axudar a identificar posibles casos B.1.1.7 que se poden confirmarmediante secuenciación, identificando variantes prioritarias que non presentanSGTF depende exclusivamente da vixilancia baseada en secuencias.

 

 

 

Denominación variante

Primeira identificación  

Mutacións características

(proteína: mutación)

No de casos actuais confirmados por secuencia No de

países con

secuencias

Localización Data Estados Unidos En todo o mundo  
B.1.1.7 (20I/501Y.V1) Reino Unido Setembro 2020 ORF1ab: T1001I, A1708D, I2230T,

del36753677 SGF

S: del6970 HV, del144 Y, N501Y,

A570D, D614G, P681H, T761I,

S982A, D1118H

ORF8: parada Q27, R52I, Y73C

N: D3L, S235F

76 15.369 36
B.1.351 (20H/501Y.V2) África do Sur Outubro 2020 ORF1ab: K1655N

E: P71L

N: T205I

S:K417N, E484K, N501Y, D614G,

A701V

0 415 13

 

P.1 (20J/501Y.V3 Brasil e Xapón xaneiro 2021 ORF1ab: F681L, I760T, S1188L,

K1795Q, del36753677 SGF, E5662D

S: L18F, T20N, P26S, D138Y, R190S,

K417T, E484K, N501Y, D614G,

H655Y, T1027I

ORF3a: C174G

ORF8: E92K

ORF9: Q77E

ORF14: V49L

N: P80R

0 35 2

 

Abreviaturas: del = eliminación;E = proteína de envoltura;N = proteína nucleocápside;ORF = marco de lectura aberto;S = proteína espiga.

A experiencia no Reino Unido e os modelos B.1.1.7presentados neste informe ilustran o impacto dunha forma máis contaxiosavariante pode ter sobre o número de casos nunha poboación.Omaior transmisibilidade desta variante require unha aínda máisaplicación combinada rigorosa de vacinación e mitigamedidas de prevención (por exemplo, distanciamento, enmascaramento e hixiene de mans)para controlar a propagación do SARS-CoV-2.Estas medidas seránmáis eficaces se se instituen máis cedo que tardepara frear a propagación inicial da variante B.1.1.7.Esforzos parapreparar o sistema sanitario para novos aumentos nos casos sonxustificado.O aumento da transmisibilidade tamén significa que maiordebe alcanzarse a cobertura de vacinación previstaconseguir o mesmo nivel de control da enfermidade para protexer ao públicoen comparación con variantes menos transmisibles.En colaboración con centros académicos, industriais, estatais, territoriais,socios tribais e locais, CDC e outras axencias federaisestán coordinando e potenciando a vixilancia xenómica eesforzos de caracterización de virus en Estados Unidos.CDCcoordina os esforzos de secuenciación dos EUA a través do SARS-CoV-2Secuenciación para a resposta ás emerxencias de saúde pública,Epidemioloxía e Vixilancia (ESFERAS)§§consorcio,que inclúe aproximadamente 170 institucións participantes e promove o intercambio aberto de datos para facilitar o uso do SARS-CoV-2datos de secuencia.Para rastrexar a evolución viral do SARS-CoV-2, CDC éimplementando vixilancia xenómica multifacética para comprenderos procesos epidemiolóxicos, inmunolóxicos e evolutivosque configuran as filoxenias virais (filodinámica);guía de broteinvestigacións;e facilitar a detección e caracterizaciónción de posibles reinfeccións, casos de avance da vacina evariantes virales emerxentes.En novembro de 2020, estableceuse o CDCo programa nacional de vixilancia da cepa SARS-CoV-2 (NS3).para mellorar a representatividade do SARS-CoV-2 domésticosecuencias.O programa colabora con 64 públicos estadounidenseslaboratorios de saúde para apoiar un sistema de vixilancia xenómica;NS3 tamén está a construír unha colección de exemplares de SARS-CoV-2 and secuencias para apoiar a resposta da saúde pública e científicainvestigación para avaliar o impacto das mutacións sobrecontramedidas médicas recomendadas existentes.CDC tentamén contratado con varias grandes labora clínicas comerciaisconservadores para secuenciar rapidamente decenas de miles de SARS-CoV-2exemplares positivos cada mes e financiou sete académicosinstitucións para realizar a vixilancia xenómica en colaboracióncoas axencias de saúde pública, aumentando así substancialmentea dispoñibilidade de datos oportunos de vixilancia xenómica de todo o mundoos Estados Unidos.Ademais destas iniciativas nacionais,moitas axencias estatais e locais de saúde pública están secuenciando

FIGURA 1. Traxectorias de incidencia de casos simulados* das variantes actuais do SARS-CoV-2 e da variante B.1.1.7,asumindo non vacinación comunitariae R t inicial = 1,1 (A) ou R t inicial = 0,9 (B) para as variantes actuaisEstados Unidos, xaneiroAbril 2021

 

figura 1
figura 2
abreviaturas
figura 1

SARS-CoV-2 para comprender mellor a epidemioloxía local eapoiar a resposta da saúde pública á pandemia.Os resultados deste informe están suxeitos polo menos a tres límitestacións.En primeiro lugar, a magnitude do aumento da transmisibilidadeidade nos Estados Unidos en comparación coa observada noReino Unido segue sen estar claro.En segundo lugar, a prevalencia deB.1.1.7 nos Estados Unidos tamén se descoñece neste momento, peromellorará a detección de variantes e a estimación da prevalenciacon esforzos de vixilancia reforzados dos Estados Unidos.Por último, mitiga localAs medidas de ción tamén son moi variables, o que leva a variaciónsR t .Os resultados específicos presentados aquí están baseados en simulacióne non asumiu ningún cambio nas mitigacións máis aló do 1 de xaneiro.O aumento da transmisibilidade da guerra de variantes B.1.1.7reclama a aplicación rigorosa das estratexias de saúde pública parareducir a transmisión e diminuír o impacto potencial de B.1.1.7,comprar tempo crítico para aumentar a cobertura de vacinación.CDCdatos de modelización mostran que o uso universal e o aumento da compliAs medidas de mitigación e a vacinación son fundamentais parareducir substancialmente o número de novos casos e mortes napróximos meses.Ademais, probas estratéxicas de persoas sensíntomas de COVID-19, pero que corren un maior riscoinfección por SARS-CoV-2, ofrece outra oportunidade paralimitar a propagación en curso.Colectivamente, vixilancia xenómica melloradalanza combinada cun maior cumprimento da saúde públicaestratexias de mitigación, incluíndo vacinación, distanciamento físicouso de máscaras, hixiene de mans e illamento e corentena,será esencial para limitar a propagación do SARS-CoV-2 eprotexendo a saúde pública.

Agradecementos

Membros da Secuenciación de Emerxencias de Saúde Públicaconsorcio de Resposta, Epidemioloxía e Vixilancia;estatal e locallaboratorios de saúde pública;Asociación de Laboratorios de Saúde Pública;Equipo de resposta á COVID-19 dos CDC;Subdirección de Virus Respiratorios,División de Enfermidades Virais, CDC.Formulario do Comité de Editores de Revista Médica para a divulgación do potencialconflitos de intereses.Non se revelaron posibles conflitos de intereses.

Referencias

1. Saúde Pública Inglaterra.Investigación da nova variante SARS-CoV-2: variante de preocupación 202012/01, información técnica 3. Londres, Reino Unido: Public Health England;2020. https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/950823/Variant_of_Concern_VOC_202012_01_Technical_Briefing_3_-_England.pdf
2. Kemp SA, Harvey WT, Datir RP, et al.Emerxencia e transmisión recorrentes dunha supresión de picos SARS-CoV-2 ΔH69/V70.bioRxiv[Preprint publicado en liña o 14 de xaneiro de 2021].https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.12.14.422555v4
3. Volz E, Mishra S, Chand M, et al.Transmisión da liñaxe SARS-CoV-2 B.1.1.7 en Inglaterra: coñecementos da vinculación de datos epidemiolóxicos e xenéticos.medRxiv [Preprint publicado en liña o 4 de xaneiro de 2021].https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.12.30.20249034v2
4. Honein MA, Christie A, Rose DA, et al.;Equipo de resposta á COVID-19 dos CDC.Resumo de orientación para estratexias de saúde pública para abordar os altos niveis de transmisión comunitaria de SARS-CoV-2 e mortes relacionadas, decembro de 2020. MMWR Morb Mortal Wkly Rep 2020;69:1860–7.PMID:33301434 https://doi.org/10.15585/mmwr.2mm
5. Volz E, Hill V, McCrone JT, et al.;Consorcio COG-UK.Avaliación dos efectos da mutación de pico SARS-CoV-2 D614G sobre a transmisibilidade e a patoxenicidade.Cell 2021;184:64–75.e11.PMID:33275900 https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.11.020
6. Korber B, Fischer WM, Gnanakaran S, et al.;Sheffield COVID-19 Genomics Group.Seguimento dos cambios no pico de SARS-CoV-2: evidencia de que o D614G aumenta a infecciosidade do virus COVID-19.Célula
2020;182:812–27.PMID:32697968 https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.06.043
7. McCarthy KR, Rennick LJ, Namnulli S, et al.As eliminacións naturais da glicoproteína de pico SARS-CoV-2 impulsan a fuga de anticorpos.bioRxiv [Preprint publicado en liña o 19 de novembro de 2020].https://www.biorxiv.org/content/
10.1101/2020.11.19.389916v18.Washington NL, White S, Schiabor KM, Cirulli ET, Bolze A, Lu JT.S patróns de abandono do xene nas probas de SARS-CoV-2 suxiren a propagación da mutación H69del/V70del nos EUA.medRxiv [Preprint publicado en liña o 30 de decembro de 2020].https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.12.24.20248814v1
9. Weisblum Y, Schmidt F, Zhang F, et al.Escapar dos anticorpos neutralizantes por variantes da proteína espiga SARS-CoV-2.eLife 2020;9:e61312.PMID:33112236 https://doi.org/10.7554/eLife.61312
10. Greaney AJ, Loes AN, Crawford KHD, et al.Mapeo completo de mutacións no dominio de unión ao receptor SARS-CoV-2 que afectan ao recoñecemento dos anticorpos policlonais do soro humano.bioRxiv [Preprint publicado en liña o 4 de xaneiro de 2021].https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.12.31.425021v1


Hora de publicación: 11-feb-2021